免疫诊断：
1.酶联免疫吸附试验(ELISA)：是诊断蓝氏贾鞭毛虫病灵敏度高、特异性强的方法。有症状者诊断阳性率为73.5%，具有快速、操作简便等优点，仅有少数交叉反应。不仅可以检查现症患者的抗体，对已往有过感染现已不排虫者，因其血内抗体可持续存在一段时间，因此也可检查。
2.间接血凝(IHA)：由于IHA操作简单，无须昂贵设备，是诊断蓝氏贾鞭毛虫病比较好的方法，阳性率73.4%。
3.间接荧光抗体(IFA)：优于IHA，血清阳性率为83.3%。
4.对流免疫电泳(CIF)试验：简便有效，适应于现场大规模流行病学调查。采用患者的新鲜粪便(其中有该虫抗原)或低温保存时间较短者，检出率较高。
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