可根据肠痉挛的评分结果决定治疗.评分参照哭吵的强度和持续时间.哭吵的伴随症状.父母对孩子哭吵的看法.如果哭吵与肠痉挛有关.但哭吵不剧用第一.第二级治疗方案；如果是严重肠痉挛者.采用第三级治疗.一.第一级治疗给孩子以抚慰.摇动孩子.减低环境噪音.用热水袋捂婴儿腹部；对家长给予支持和关心；可服用中药或二甲基硅油.一些中药具有解痉作用.服用中药（洋甘菊.马鞭草.甘草.茴香.香峰草及薄荷组成的粉末）7天后.肠痉挛改善.但夜醒次数未见减少.二甲基硅油是一种非吸收性药物.通过改变气泡表面张力.使气泡融合或弥散.促进气体排出.对人体无副作用.试图用它来减少肠道气体.但有关它的研究结果并不一致.用二甲基硅油与安慰剂做自身交叉对照研究.1/4-2/3患儿症状有改善.但与安慰剂相比.无明显差异.其他减少肠道气体的药物如活性碳.α-半乳糖苷酶能吸附气体或帮助消化高纤维素食物.减少发酵产气.但目前对肠痉挛的疗效尚不肯定.二.第二级治疗即药物治疗.可用解痉药（如西托溴铵）能阻断平滑肌的毒蕈碱型受体.还可直接作用于平滑肌.解除平滑肌痉挛.无效者可用盐酸双环胺.它作为一种抗胆碱能药物.具有阿托品样的解痉作用.并有一定的中枢安定作用.在治疗婴儿肠痉挛方面有一定的疗效.但近来有研究发现.6个月以下的婴儿用此药可发生呼吸暂停.使此药的应用受到限制.至今尚无一种完全有效的药物来治疗肠痉挛.三.第三级治疗改变饮食和/或药物治疗.母乳喂养的母亲不食用牛奶.奶制品.鱼和蛋；人工喂养儿给予豆奶或水解酪蛋白的奶方.能明显改善婴儿肠痉挛.对于CMPI引起的肠痉挛者.去除牛奶蛋白.改用豆奶或水解蛋白后.71%-88%的患儿症状有改善.由于药物治疗（如盐酸双环胺）有一定的副作用.而且有时疗效不理想.饮食改变可能比用药更适宜.
