非特异性尿道炎与淋病一样，多发生于青年性旺盛期，绝大部分是通过性生活传播，也有少数是通过密切接触。60年代以来非特异性尿道炎发病率骤增，在欧美已超过淋病居性传播疾患发病率的首位，近年来，在我国非特异性尿道炎发病率有增高的趋势。非特异性尿道炎的病原体包括衣原体和支原体。
一、衣原体 根据许多国家报告，NGU中30%-50%，淋病病人中20%都患有衣原体感染，性活动强但无尿道炎症状的人中0.5%有衣原体感染。以目前常用的检查方法，尿道分泌物可查出衣原体抗原。女性病人因多数无症状或仅表现为白带增多等妇科症状，难以确定其发病率，有人估计女性病人可能为男性的4倍。 衣原体是一种寄附于腺上皮细胞胞浆内的微生物。呈球型，有特殊的生长周期。每个生长周期有两种发育型。
感染型为原体（elementarybody）呈球形，大小介于细菌与病毒之间（300-400mm）。原体可在细胞外生存，有感染性。当其附着在易感细胞表面时，被细胞吞饮，在细胞内原体变成另一种繁殖型。繁殖型即始体（initialbody）始体呈圆形或椭圆形。始体按二分裂方式繁殖，最后始体重新组织成原体，从细胞内释放出来，再感染其他健康易感细胞。整个生长周期为72h。 衣原体分类：1、鹦鹉热衣原体。2、沙眼衣原体（Chlamydiatrachomatis） 沙眼衣原体至少有15个血清型。D-K8种血清型与NGU有关。L1、L2、L33个型与性病性淋巴肉芽肿（第四性病）有关
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