乙肝病毒造成胃黏膜损害的原因可能与下列因素有关：
乙肝病毒存在于胃黏膜上皮细胞内，由于乙肝抗原———抗体免疫复合物在细胞中沉积而引起炎症反应，从而削弱和破坏了胃黏膜的屏障保护作用。
患乙肝后，胃酸形成的功能紊乱，导致胃酸过多，过多的胃酸会损害胃黏膜，胃酸过多与胃溃疡的发生相关。
免疫功能紊乱，产生自体免疫反应，导致胃黏膜损害。
肝功能受损后，肝脏对激素的灭活功能减退，白蛋白的含量降低，这就减弱了对胃黏膜的修复能力。
药物刺激所引起。乙肝患者，特别是慢性乙肝患者需较长时间服药。病人求愈心切，往往服药种类过多，或几种药同时服下，忽视了药物间的相互作用会对胃黏膜产生刺激。有些药物本身就对胃黏膜有刺激作用，特别是有些苦寒性中草药对胃有一定的刺激作用。
有些慢性乙肝患者有不同程度的肝硬化、门脉高压，使胃部血流缓慢，胃黏膜下瘀血，胃黏膜因缺血缺氧及营养障碍而致损害。
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