治疗肛门瘙痒症还可以用手术疗法。手术方法有除去肛门部皮肤神经支配和切除肛门部皮肤两种。
⑴皮下切开术：于肛门两侧，距肛缘5cm，各作一半圆形切口，切开皮下脂肪，将皮片向内侧分离显露外括约肌下缘，并向肛管内将皮肤由内括约肌分离到肛门瓣平面。再将肛门前后方皮肤由深部组织分离，使肛门两侧伤口交通。最后将切口外缘的皮肤向外分离1～2cm，止血后将皮片缝于原位，有时需放引流，外盖压迫敷料。手术前需准备肠道，手术后控制排粪3～4日。效果，各家报告不一，多数取得良好效果，但有复发病例及伤口感染和裂开的报告。
⑵切除缝合术：沿肛缘由前向后作一切口，在切口外侧再作一弯形切口，将有病变皮肤包括在切口内，切口两端相连，切除2处切口之间的半月形皮肤，缝合伤口。对侧同法切除。切除皮肤后可止瘙痒，但伤口有时发生感染。
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