轮状病毒性肠炎无特效疗法，以对症治疗为主。暂停乳类及双糖类食物；吐泻较重时用止吐剂及镇静剂；口服或静脉补液以纠正和电解质紊乱。 由于抗生素可能会引起腹泻或促进耐药菌生长，即使胃肠炎的致病菌已经明确，抗生素通常也不建议使用。但是，其他病原菌（如弯曲杆菌、志贺菌、霍乱弧菌等）感染或患者有旅行者腹泻，可使用抗生素。
