病毒性肠炎应及早发现并隔离病人，并对病人粪便应消毒处理。婴儿室应有严格的消毒隔离制度，并提倡母乳喂养婴儿。对6-24月龄幼儿口服含各型轮状病毒的减毒疫苗，可刺激局部产生IgA抗体，为目前最为有效的预防措施。
