盆腔囊肿多与盆腔炎反复感染引起，由于长期炎症剌激，造成盆腔器官周围组织增厚粘连，抗炎药物不易有效，故病情顽固，反复发作，导致患者体质日虚，恢复缓慢。因为囊肿的形成由于盆腔手术或炎症损伤后所形成的严重粘连，渗出的纤维素机化粘连包裹了输卵管卵巢具有分泌功能的组织，使其产生的分泌液和渗出液逐渐积聚在粘连间隙扩张成单一的囊腔。
生理性盆腔积液是由卵巢产生的，因为腹腔积液中的卵巢激素以雌激素为主。如果腹膜被感染或是损伤，吸收能力下降，由卵巢分泌的液体就可能被周围瘢痕腹膜所包裹，形成盆腔包裹性假囊。盆腔手术(子宫切除术)后盆腔腹膜的损伤造成或术后炎症反应导致盆腔粘连，或术中止血不彻底致术后盆腔积血，是术后盆腔囊肿形成的主要原因。
