睾丸疼痛是最常见的造成男性睾丸疼痛的原因。睾丸疼痛是由于睾丸引发疼痛症造成的。多数的情况下是由于睾丸疾病恶化引发的，由于疼痛症的刺激使睾丸出现疼痛的感觉。而且睾丸疼痛的存在会严重损伤到男性的睾丸功能，使睾丸产精子的能力下降，如果不及时治疗，就会造成男性不育。
引起睾丸疼痛还有附睾疼痛的原因，男性的附睾紧邻睾丸。附睾受到感染引发疼痛症也会扩散至睾丸，同睾丸疼痛一样，会刺激睾丸，导致男性睾丸疼痛。附睾疼痛同样会损伤睾丸，导致男性不育。
阴囊发疼痛也是造成男性睾丸疼痛的原因。阴囊负责精子的成长发育，同时负责暂时贮存精子的功能。阴囊发疼痛不但刺激男性睾丸，而且还会损伤精囊内精子，造成精子死亡，从而降低了男性的生育能力，导致男性不育。
男性睾丸疼痛的原因还有其它的一些疾病疼痛症，比如前列腺疼痛，男性内分泌失调，尿道感染等等这些疾病的存在都会导致男性睾丸疼痛。
常在重体力劳动后发生，如举扛重物后等，也可以在较强烈的性兴奋后出现。除此之外，经尿道器械操作所致的损伤可导致附睾疼痛，前列腺摘除术后也可并发附睾疼痛。
