具有典型尿路感染的临床表现和尿细菌学检查阳性者易于诊断，但不典型的尿路感染病例则容易误诊。造成误诊的主要原因是对本病的复杂性、多样性认识不足，未能及时进行实验室检查，或有时未准确了解实验室检查的意义。在临床上，不典型的尿路感染占有相当大的比例，因此，对于这类患者进行鉴别诊断是重要的。本病主要应与尿道综合征、肾结核、肾小球疾病、前列腺炎、尿路结石、发热性疾病、腹部器官炎症等鉴别。
1、发热性疾病
有部分急性尿路感染的病人以发热为主症，尿路刺激症状不明显，易与发热性疾病，如流感、上呼吸道感染、疟疾、败血症等混淆。但若能详细洵问病情，不疏漏尿路感染的局部症状，并及时查尿沉渣，甚至作尿细菌学检查，则鉴别诊断不难。
2、腹部器官炎症
有些尿路感染病例主要表现为腹痛、恶心、呕吐、发热、血白细胞数增高，易误诊为急性胃肠炎、阑尾炎、附件炎等，若能及时查尿，易于鉴别。
3、肾结核
肾结核以血尿为主要表现，伴有明显的膀胱刺激症状，易误诊为泌尿系感染。但如患者经过积极抗炎治疗后，仍然有尿频、排尿不适感或尿沉渣异常，应高度重视有无肾结核，仔细检查是否有肺结核或盆腔结核的存在，同时作皮肤OT试验，血结核抗体检查，尿沉渣涂片找抗酸杆菌和结核培养，如为阳性，应诊断为肾结核。
4、无症状性菌尿
亦称隐匿性菌尿，指病人有真性细菌尿，而无泌尿系感染的临床症状。无症状性菌尿常见于女性，临床上常无泌尿系感染的症状和体征，尿常规检查改变不明显，仅有细菌尿。此病可由症状性泌尿系感染演变而来。致病菌多为大肠杆菌。其细菌可来自肾脏或膀胱，故对有持续性细菌尿的病例需进一步定位，并检查是否有泌尿系解剖上的异常，给以恰当的治疗。
5、尿道综合症
又称无菌性尿频—排尿不适综合症。病人间歇或持续出现尿频、尿急、排尿疼痛症状，常以尿频为主要表现。多为女性，但多次尿培养均无细菌。其病因尚不明确，但是有人认为，与尼龙裤、妇科炎症、过分焦虑、尿道动力学功能异常等因素有关。急性尿道综合症在临床上常可见到，有时中年女性雌激素分泌降低，阴道和尿道粘膜分泌的粘液减少，同时会引起阴道、尿道粘膜干涩，局部抵抗力降低、易引起泌尿系感染外，无泌尿系感染时亦可出现排尿不适感，且反复多次作尿沉渣和尿培养均阴性。在这种情况下，给予小剂量的尼尔雌醇治疗，同时穿宽松的棉内衣裤对症状有明显改善。另外，诊断此病时要同时排除泌尿系结核、厌氧菌、真菌、淋球菌、支原体、衣原体感染。
6、隐匿性肾小球，肾炎
此病以单纯血尿或单纯性蛋白尿为主。但有些病人会伴有白细胞尿，但这类病人给予相应的抗炎治疗后，红细胞尿、蛋白尿仍然持续存在。必要时可作肾活检进行鉴别。
求医网温馨提示：泌尿系感染的发病原因，性生活卫生习惯不良较为常见，男女一方外阴或阴道、尿道的病菌极容易传给对方，也容易自身感染。因此性生活前，应清洗外生殖器。如果使用避孕工具，应将避孕工具清洗或消毒。性交前后，都应排尿一次。此外，戒除手淫，尤其是用器物手淫，防止尿道感染和损伤。
【参考文献：《泌尿生殖系统感染性疾病的诊断与治疗》《临床泌尿科急诊学》】
