在胚胎的发育过程中睾丸的正常下降受到内分泌激素和物理机械因素的影响，影响睾丸下降的物理因素有睾丸系带由提睾肌的牵引作用腹内推压睾丸降至阴囊内，正常的附睾发育也是睾丸下降的因素。隐睾的异常位置停留的时间越长，所居位置越高，睾丸的损害越大，其主要不良后果包括：如果睾丸没有下降到阴囊内，出生二年内还只有轻度的组织改变，包括生精小管变细，生精少，小管周围组织 增强，间质细胞增加或减少而支持细胞增加，随后的一年更明显，表现为胶原纤维增宽丶变密，加重小管的病理损害，进而致生殖母细胞转化发生障碍。故出生后第二年时有38％患儿的睾丸没有生殖细胞。
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