在临床上的很多疾病存在相似的地方，这就需要大夫在看病的时候需要做好疾病的鉴别工作，针对于肠炎这种疾病来讲在临床上也有很多相似的疾病，为此专家建议建议大夫在治疗的时候一定要做好疾病的诊断鉴别工作，防止意外的发生。
(1)原发性小肠吸收不良综合征：本病典型症状为脂肪泻。大便色淡，量多，呈油脂状或泡沫状，常浮于水面多有恶臭味。多伴腹胀、腹痛，有乏力、体重下降、出血等营养不良表现，病程长，病情时轻时重，做X线钡餐检查有利诊断。
(2)肠结核：起病缓慢，多位于右下腹部，可有阵发性绞痛，肠鸣音增强，常有大便习惯改变，干、稀交替。轻者仅有稀便，重者为粘液脓血便。可有恶心、呕吐、腹胀，食欲减退。体检仅有右下腹压痛。辅助检查：血沉增快，结肠菌试验阳性，大便培养可找到抗酸杆菌。给予纤维肠镜检查以确认本病。
(3)克隆病：是一种原因不明的慢性肠道炎症性疾病，起病缓慢，有消瘦、纳呆、乏力等表现。腹痛位于脐周或右下腹。腹泻初为间歇性，以后渐为持续性。日行3～6次，软便或半液状。右下腹压痛，可触及包块。晚期呈现消瘦、贫血、肠吸收不良及电解质紊乱等表现。肠系膜动脉造影或内窥镜及活组织检查，可明确诊断。
和肠炎容易混淆的疾病以上专家已经阐述的很清楚了，一旦发生肠炎，如果长时间的拉肚子的话，就会出现水电解质的紊乱，肠炎这种疾病还会导致身体营养不良，为此大夫在用药的时候也要考虑到肠炎患者的营养状况。
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