疾病因素（35%）
复发性阿弗他溃疡与胃溃疡、十二指肠溃疡、溃疡性结肠炎、局限性肠炎、肝炎、肝硬化、胆道疾病有密切关系。内分泌系统的疾病如糖尿病、月经紊乱等也与复发性阿弗他溃疡有一定关系。
环境因素（20%）
心理环境、生活工作环境、社会环境等与复发性阿弗他溃疡有很大关系。食物中缺乏锌、铜、铁、硒等元素，或维生素B1、(TXB2)与6酮前列腺素F1а(6K-PGF1а)比例推敲及总体水平下降与血管内皮细胞操作有关，从而导致复发性阿弗他溃疡。微循环障碍与复发性阿弗他溃疡发病有关。吸烟者复发性阿弗他溃疡发病率较不吸烟者低。
免疫因素（15%）
①细胞免疫异常;②体液免疫异常和自身免疫;③免疫功能低下和免疫缺陷。
遗传因素（15%）
对复发性阿弗他溃疡的单基因遗传、多基因遗传、遗传标记物和遗传物质的研究表明，复发性阿弗他溃疡的发病有遗传倾向。
