眼睛
百分之二十到四十的AS病人会合并有葡萄膜炎(uveitis)与虹彩炎(iritis)，症状为突发性的单边眼睛红肿充血、刺痛感、畏光及视力模糊。通常是两边交替，反复发生，很少两边同时发作。若有葡萄膜炎与虹彩炎，需要找眼科医师好好地治疗，通常可以完全恢复。
肾脏
约15%的AS病人会并发A型免疫球蛋白肾炎(IgA nephropathy)，为无症状的显微性血尿或蛋白尿，幸而A型免疫球蛋白肾炎多半并不会造成肾功能的衰竭，也很少会到洗肾的地步。为无症状的轻微血尿
心脏
少数病人会合并心脏的侵犯，大多是无症状且轻微的主动脉瓣闭锁不全或传导阻滞或心律不整，很少影响心脏功能，也通常不需要治疗。
肺脏
强直性脊柱炎病人通常肺活量会稍差，极少数病人会造成肺部纤维化。
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