潜伏期一般7～10 天（2～21天）。典型临床经过可分为三期。
1.卡他期（痉咳前期） 开始症状类似感冒，除咳嗽外，可有流涕、喷嚏，轻度或中度发热，伴头昏、全身不适等症状。3～4 日后热退，“感冒”症状消失，但咳嗽日益加重，日轻夜重，渐呈痉咳状。此期传染性最强，一般可持续1～2 周。
2. 痉咳期 阵发性痉挛性咳嗽为本期特点。为突发性连续一二十声急促痉挛性咳嗽，使病人处于连续呼气状态，咳至终末方有一次深长吸气，因此时喉部仍呈痉挛状态，故发出高音调的鸡鸣样吼声，接着又发生下一次的痉咳，如此反复发作多次，直至咳出粘稠痰液为止。不久又复发作。痉咳时可有大、小便失禁。患者两眼圆睁、颈静脉怒张、面红耳赤、涕泪交流、口唇紫绀、双手握拳屈肘、头向前倾、张口伸舌、身体缩成一团，表情极其痛苦。多次发作后，舌系带溃烂，眼睑及颜面浮肿，球结合膜充血，鼻出血或痰中带血。轻者一日发作数次，重者一日数十次，以夜间发作为多。当奔跑、进食、烟雾、打哈欠、喷嚏、哭吵等均可诱发。发作前一般无明显预兆，间隙期亦无明显特殊。痉咳频繁者常影响睡眠，致使患儿疲倦、不爱活动、食欲减退、营养不良。如无继发感染，一般体温正常，肺部呼吸音无特殊或有不固定的音。重症病例可反复抽搐、意识障碍，甚至昏迷，可伴有脑膜刺激征或病理反射等神经系统异常表现。新生儿和幼婴无典型痉咳，因声门狭小或因声带痉挛使声门关闭，加之粘稠分泌物阻塞而发生呼吸暂停或摒气，面部及口唇紫绀，可伴惊厥及遗尿。如不及时抢救可窒息死亡。此期约持续2～6周（数日至两个多月）。
3. 恢复期 阵发性痉咳逐渐减轻或消失，次数减少，其它症状随之好转，一般持续2～3 周后康复。如有并发症，此期可延长数周至数月。此期一般无传染性。百日咳最常见的并发症是肺炎，肺炎可由百日咳杆菌引起，但更常见的是继发的流感嗜血杆菌、肺炎球菌、化脓链球菌或金黄色葡萄球菌感染所致。当百日咳出现明显发热时，应考虑并发肺炎。中枢神经系统并发症最严重，但少见。最常发生于痉咳期，婴儿发生率最高。表现为全身抽搐，局部抽搐亦可见到。此外可有偏瘫、全瘫、耳聋、失眠、共济失调和失语。脑脊液一般正常，有时脑脊液中淋巴细胞轻度增加，蛋白质含量达1g/l。有神经系统并发症者预后较差，有脑病者病死率及有后遗症者各占1/3，仅1/3完全恢复。长期后遗症包括抽搐、面部麻痹、智力迟钝、行为异常等。中耳炎亦为较常见并发症。其它并发症如脐疝、各部位出血等少见。
(实习编辑：HF)
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