疣状表皮发育不良，临床表现也与普通扁平疣有很大的不同，一般来说，“疣状表皮发育不良”的皮损呈全身泛发，而普通的扁平疣往往只出现在面部、手背部，顶多出现在前臂部，而不会呈现出全身泛发；两者的皮损也有很大的区别：扁平疣的皮损一般较小且呈隆起状，颜色呈肉色或者灰色，而“疣状表皮发育不良”的皮损一般较大且不突起于皮肤，颜色呈污褐色，上面可覆盖有薄薄的小鳞屑。当然，非皮肤科专业人士甚至初学皮肤科的医生对二者的准确界定可能有一定的难度，因此，如果怀疑患有“疣状表皮发育不良”，应早日找皮肤科专家予以确诊！
近年来，越来越多的证据表明，“疣状表皮发育不良”往往有家族史、遗传性，癌变机率更高达20%，比普通意义上讲的扁平疣癌变机率要高得多！治疗难度也要大得多。“疣状表皮发育不良”关键的病因在于患者免疫系统缺陷，遭遇“人类乳头瘤病毒”感染是外在因素，也是不容易避免的（因为我们身边到处存在“人类乳头瘤病毒”）。还有很多发病机理尚未完全明确，其病因、病机要比通常意义上讲的扁平疣复杂得多，有待于人们做更进一步的研究。某些书籍把“疣状表皮发育不良”归入扁平疣，称为“泛发性扁平疣”，原因是在“疣状表皮发育不良”患者的体内发现了“人类乳头瘤病毒”，因此认为是一种特殊类型的扁平疣。但是，笔者一直不同意这种分类方法，因为导致“疣状表皮发育不良”发病的主要原因是患者先天缺乏对某些病毒的免疫力，这是根本内因！遇到“人类乳头瘤病毒”被感染而发病只是一个外因！
需要特别强调的是：扁平疣如果经过不正确的治疗，如激光、电离子、疣体自身埋植术以及搔抓、外伤后，容易导致变本加厉的“同型反应”，严重者可转化为疣状表皮发育不良！
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