亚急性甲状腺炎又称肉芽肿性、巨细胞性甲状腺炎，其发病原因与病毒感染有关，起病前常有上呼吸道感染史，患者血中可检出病毒抗体，最常见的是柯萨奇病毒，其次是腺病毒抗体、流感病毒及腮腺炎病毒抗体。多见于20～50岁女性，女性发病是男性的4倍以上。
亚急性甲状腺炎常继发于流行性感冒和病毒性腮腺炎，故一般认为其病因可能是病毒感染。感染可破坏甲状腺滤泡，释放出的胶体引起甲状腺组织内的异物样反应。在组织切片上可见到白细胞浸润和很多吞噬有胶体颗粒的巨细胞。
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