引起女性性高潮障碍的原因很多，主要是社会心理精神性因素。国外学者对大量患性高潮障碍的女性作了研究，发现95%以上的患者是由于精神心理因素引起。只有少数病人（＜5%）是由于患有器质性疾病而出现性高潮障碍，如破坏调节性高潮反射的脊髓中枢的退行性疾病或肿瘤，阴蒂或阴道上皮神经末梢有缺陷，患有内分泌疾病如糖尿病、甲状腺功能低下、下丘脑-垂体-性腺功能不全等所引起。
1.社会心理精神因素
（1）社会环境因素：很多性心理学家认为，现代文明社会里的妇女，其性反应通常有所束缚，而不能像原始社会那样让性反应自然而强烈地流露。因此，对女性的性知识教育往往有些片面和缺乏科学依据，在少年时期给予女性以否定性生活的文化熏陶，以致使很多妇女对性知识处于无知或存在误解。尤其在我国，长期受封建礼教男尊女卑的影响，性知识教育贫乏，女性在整个童年期、青春期和成年期接受抑制性行为的教育，要求女性抑制性感情和性行为。长此以往，使得许多女性在婚后性生活中仍有意抑制自己，在性活动中表现出羞怯、被动，故而影响性高潮的出现。
（2）心理精神性因素：心理性因素可以导致女性性高潮抑制，如女性经历过性创伤往往容易使其对性产生恐惧，有些女性担心性交疼痛，害怕妊娠和流产，或惧怕经历性快感或性高潮时导致情绪失控。或者由于情感因素及心理疾病（如精神抑郁、焦虑及强迫症等）均可引起性高潮障碍，前者如精神过度紧张、工作生活压力大、岗位竞争激烈、受到惊吓、烦恼、忧伤，或者自觉容貌平庸、形象欠佳、才疏学浅而产生自卑情绪，有意回避性接触。有些女性身体欠佳，或患有其他疾病，担心自己不能满足丈夫的性要求而存在焦虑心理。有些患有精神疾病的患者，如抑郁症、焦虑症及精神分裂症等，其本身也均可引起性高潮障碍。
2.器质性因素临床并不多见，主要见于生殖泌尿系统的疾病，例如外阴、阴道、子宫及附件、膀胱、尿道的疾病以及盆腔炎、肿瘤等，性交时会引起疼痛和不适，因而也就抑制了性高潮的出现。全身其他系统的疾病，都会不同程度地抑制和干扰性反应，破坏性高潮的获得。女子患有生殖器官发育不良、卵巢内分泌功能不全、较严重的神经衰弱症、结核病、肝肾功能不全、影响脊髓或外周盆腔器官神经支配的疾病（脊髓损伤或肿瘤、多发性硬化、糖尿病周围神经病变、肌萎缩性侧索硬化、严重的营养不良和维生素缺乏、脊髓灰质炎等）、阴道血循环障碍（血栓性梗阻、严重动脉粥样硬化）等，或者患有内分泌疾病如糖尿病、甲状腺功能低下或亢进、下丘脑-垂体-性腺功能不全等都可引起性高潮障碍。
Kolodny等研究表明患糖尿病的女性约有35.2%无性高潮。除此之外，损伤、创伤或手术及药物去势、盆腔放疗和长期应用避孕药，以及患神经系统疾病如精神病，有抑郁、焦虑、妄想和强迫感等症状，又服用抗抑郁类药物治疗，在双重影响下，无疑将会出现女性性高潮障碍。
3.药物因素有的女子患有精神疾病，长期服用抗抑郁类药物治疗，可导致女性性高潮障碍。有学者指出，5-羟色胺（5-HT）再摄取抑制剂（SSRIs）如氟西汀、帕罗西汀、舍曲林等是治疗精神分裂症常用的有效药物，其作用机制是阻断5-HT能神经末梢触突前膜对5-HT的再摄取，使脑内5-HT增加，有抗忧郁作用，但可引起性高潮抑制，表现为性欲降低或性高潮缺乏，停药后可恢复正常。近来有报道，西地那非可以成功治疗SSRIs导致的女性性高潮障碍。
其他能改变病人精神状态、神经传导、生殖器官血流供应和性激素水平的药物都有可能导致性欲减退、性功能低下，或者出现性高潮障碍。
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