就肾小管性酸中毒这一病症看，其大都需要长期治疗，甚至需终生治疗。因此，确诊为该症的患儿也同样需要如此，这对于患儿及其家属们来说无疑是十分痛苦的。但尽管如此，患儿还是需要定期门诊并测定血的pH值，碳酸氢盐浓度和尿钙排出量，而且须谨慎的调整药物剂量。
一般而言，肾小管性酸中毒患儿的预后取决于早期的诊断，患儿需要进行早期合理的治疗和长期坚持规律性的治疗。如果患儿能够做的早期合理的治疗，便可预防严重的肾钙化和肾功能不全，其预后效果较好。但如果中断治疗，代谢性酸中毒所导致的临床症状可复发，就会导致肾功能不全或肾衰竭，气预后效果不良。
总而言之，肾小管性酸中毒患儿的预后与早期的诊断、治疗及坚持长期治疗是成因果关系的，如果患儿能及早确诊、治疗并且坚持长期治疗，那么，其预后还是比较理想的。反之则相反。
