二尖瓣病变发生时,经常会出现左心房的血栓.血栓完全是由血液凝固形成的,形成时间长的，可能发生纤维化,比较坚硬，但多数情况下，血栓是非常脆弱的，稍有影响，就可能脱落,随血液被冲到身体的其他部位,从而形成不同部位的栓塞。
一般脏器发生小的栓塞时,不会影响功能,甚至不会有什么感觉，但是，一旦重要的脏器发生栓塞，则可能表现出功能方面的异常.在常见的栓塞部位中，脑栓塞发生的几率是非常大的.这可能与脑血管的结构有关。另外，也和脑对缺氧的耐受能力差有关。
脑栓塞发生后，如果时间较短,一般不主张立即手术治疗，因为体外循环有可能使栓塞的部位出血,从而加重病情。不过，这只是一种猜想而已,临床上并没有确实的证据表明这种情况发生。
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