粒细胞缺乏症严重的并发症有中毒性脑病或中枢神经系统感染，可出现头痛、恶心、呕吐、意识障碍，甚至昏迷。药物过敏者可发生剥脱性皮炎，若短期内不恢复，死亡率极高，起病急骤、高热、寒战、头痛、极度衰弱、全身不适。由于粒细胞极度缺乏，机体抵抗力明显下降，感染成为主要合并症。
