葡萄胎的真正发病原因不明，病例对照研究发现葡萄胎的发生与营养状况，社会经济及年龄有关，病因学中年龄是一显著相关因素，年龄大于40岁者葡萄胎发生率比年轻妇女高10倍，年龄小于加岁也是发生完全性葡萄胎的高危因素，这两个年龄阶段妇女易有受精缺陷，部分性葡萄胎与孕妇年龄无关。
通过细胞遗传学结合病理学研究证明两类葡萄胎各有遗传学特点，部分性葡萄胎核型常是三倍体，80％为69，XXY，其余是69，XXX或69，XYY，来自一个正常卵子与双精子受精，由此带来一套多余的父方染色体成分；也可由于一个正常的单倍体卵子（或精子）与减数分裂失败的二倍体配子结合所致。
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