详细询问病史及体格检查，做包括肛查在内的全面体格检查，吐泻物性状的观察或化验检查，确定是否存在消化道出血遵循诊断疾病的定位与定性原则，迅速做出判断。
1、确定出血是否来自新生儿首先确定出血是来自于母亲还是新生儿自身，可作Apt试验。
2、确定出血部位确定出血来自上消化道还是下消化道，对出血进行初步定位，定出是十二指肠提肌以上的消化道出血，抑或以下的消化道出血。
(1)上消化道出血：急性上消化道出血的主要临床表现是呕血与黑便，其中主要根据血便之性状来判断黑便者往往是上消化道出血，因一般情况下，上消化道出血时，血中血红蛋白的铁与肠内硫化物结合成为硫化铁，大便呈柏油样黑色但如出血量大，肠蠕动过快，则出现暗红色甚至鲜红色的血便。洗胃后胃抽取液带有鲜血时则为胃以上消化道出血，但应排除因胃管对黏膜的操作性损伤。
(2)下消化道出血：下消化道出血所排出的多是较鲜红或鲜红色的血便，呕血带胆汁时往往为下消化道出血，但出血部位往往在下消化道的上段，此外，还应参照失血量与呕血和(或)便血性状间的相互关系来分析下消化道出血又需立即排除肛门直肠或乙状结肠的出血。但是两者均可有例外，如幽门以下部位出血量多，血液仅流入胃，也可引起呕血，又如幽门以上出血量少，则血液全部流入肠内可不引起呕吐反射。必要时应采取特殊的检查方法以确定出血部位及性质。
3、排除全身性疾病和凝血障碍所致的出血急性消化道出血大多数是由消化道疾病所致，少数病例可能是全身性疾病的局部表现。一般来说前者的临床征象主要表现在消化道局部后者则全身症状较显著，除消化道出血外，往往并有其他部位出血现象。详细的病史与体检及其他血液学方法检查有助于诊断。
