造成食管损害有很多因素，可概括为:
1、食管裂孔疝：在过去40余年，关于食管裂孔疝在胃食管反流的病理发生和病理生理学方面所起的作用是一个研究的热门话题。
2、肥胖：肥胖和GERD的关系还不清楚，肥胖病人是否更易患食管裂孔疝亦无定论。有关肥胖与食管裂孔疝、食管炎、胃排空和pH监测等因素之间的关系有很多研究。
3、饮酒：饮酒可抑制食管的酸清除能力，损害食管运动功能，降低LES压力。
4、吸烟：吸烟可致食管酸清除时间延长，此为唾液分泌量减少之故。即使无反流症状，吸烟者的酸清除时间比非吸烟者也延长50％；吸烟者唾液中的HCO-3含量仅为同等年龄的非吸烟者的60％。吸烟者唾液分泌减少是抗胆碱能作用所致，如同病人应用了抗胆碱能药物而唾液减少一样。食管压力测定显示，连续吸烟2支引起LES压力下降，停止吸烟后2～3min内压力恢复正常。
5、药物：许多药物影响食管胃的功能，促使反流的发生，这些药物的作用不外乎改变LES压力，影响食管运动和胃排空。
6、幽门螺杆菌：有许多研究观察了幽门螺杆菌和胃食管反流之间的关系。多数研究显示此种病原菌与胃食管反流无关。
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