卵巢黏液性肿瘤的治疗主要采取手术切除，辅以放化疗综合治疗。
1、良性黏液性囊腺瘤：手术切除，效果较好。过大的肿瘤不易完整取出时，可先抽取囊内液体，但应防止内容物溢出，以免囊液染腹盆腔形成种植，可能引起腹膜假黏液瘤(pseudo-myxoma peritonei)。
2、交界性黏液性囊腺瘤：以手术为主，需根据临床分期来决定手术范围，应尽量切除一切肉眼所见的肿瘤。注意有无合并腹膜黏液瘤或假黏液瘤，最好同时切除阑尾，术后辅以化疗。
3、黏液性囊腺癌：与浆液性癌治疗方法相似。
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