松果体瘤中最常见的是生殖细胞瘤和畸胎瘤。松果体瘤中75％～80％是恶性的，其中包括生殖细胞瘤、癌、成松果体细胞瘤和某些胶质瘤，其余为良性肿瘤，如松果体细胞瘤、畸胎瘤、皮样囊肿等。
松果体的畸胎瘤的绒毛组织和生殖细胞瘤都可以分泌HCG，分泌的激素足够引起性早熟。这样的肿瘤具有绒毛膜癌的组织学和功能特征。
同时，松果体瘤导致性早熟可能由于肿瘤压迫或破坏影响下丘脑的调节功能或HCG的分泌。神经内分泌解剖结果认为，由于脑的其他肿瘤扩大延伸到松果体引起性早熟。引起性早熟的另一可能原因是由于松果体产生一种抑制垂体分泌促性腺激素的物质，如松果体被破坏，抑制作用消失，产生性早熟。也可能肿瘤超越松果体区域，引起第三脑室积水或损害下丘脑，从而引起性早熟。
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