衣原体是有独特发育周期的原核细胞型微生物。其原体具有感染性，侵入细胞后发育形成始体也称为网状体，不具感染性，在细胞内生长和复制约24～40小时后，转化为原体，并释放到细胞外，再感染新的宿主细胞。沙眼衣原体对热敏感，在56～60℃时仅能存活5～10分钟，但在-70℃条件下，能保存数年。它能诱导机体产生细胞免疫和体液免疫，但这些免疫应答的保护性不强，常造成持续感染、隐性感染和反复感染。生殖道慢性沙眼衣原体感染时，潜伏在细胞内的病原体可逃避机体的免疫防御机制，而长时间存在。沙眼衣原体可由宫颈上行到子宫和输卵管可引起无症状的上生殖道感染，导致异位妊娠、原发性不育。
生殖道沙眼衣原体感染的病理和临床表现：沙眼衣原体常与淋病菌、厌氧菌、兼性革兰阴性杆菌及支原体共同导致妇女盆腔炎、不育症及异位妊娠。孕妇有宫颈沙眼衣原体感染者，其产后感染率明显高于无感染者。另外，沙眼衣原体患者可通过性接触传给性伴侣导致泌尿系感染。
1、子宫颈管炎：宫颈是沙眼衣原体最常见的感染部位。它只侵及宫颈管柱状上皮细胞，引起宫颈管局部充血、水肿和子宫颈管流出大量脓性分泌物。其分泌物中可见多核白细胞。在检查宫颈时，可见其质地脆、易出血，并有重度糜烂。但是，此时患者自觉症状轻微或无症状。而部分患者亦可有急性前庭大腺炎与泌尿系感染症候群。如未得到及时治疗，其炎症向上蔓延，可引起子宫内膜炎、输卵管炎、附件炎和盆腔炎。
2、子宫内膜炎：宫颈沙眼衣原体感染时，约有半数患者伴发子宫内膜的炎症。其临床表现有下腹痛、腰部酸痛、发热、月经过多、阴道不规则出血等。检查宫颈口，可见大量脓性分泌物，有子宫压痛。
3、急性输卵管炎和盆腔炎：急性输卵管炎是女性生殖道沙眼衣原体感染最严重的并发症。在美国约30％～67％的急性盆腔炎是由沙眼衣原体感染导致。沙眼衣原体侵入输卵管后，引起一过性输卵管内膜纤毛细胞及分泌细胞的破坏，机体可自行修复。此时，患者可以无发热、腹痛、白带增多等症状。而机体如果再次感染沙眼衣原体或潜存的沙眼衣原体复活感染周围细胞，则输卵管内膜纤毛细胞及分泌细胞就会再次遭到破坏。沙眼衣原体侵入腹腔，会引起脏器炎性反应、周围粘连。此时，患者会自觉下腹痛；有的患者无明显疼痛，仅在内诊和性交时才感到疼痛。
4、慢性炎症：由于沙眼衣原体感染在女性体内持续存在，或由于性伴侣带有沙眼衣原体通过性生活反复感染女性，其输卵管内膜细胞会发生变性，输卵管也会与周围脏器发生粘连，使输卵管蠕动发生障碍。这种病变达到一定程度，可影响受精卵的运送，发生宫外孕；严重者输卵管的管腔闭塞，导致输卵管性不孕。
5、孕期感染：美国孕妇子宫颈沙眼衣原体感染率为2％～37％，每年约10万以上的新生儿被感染。孕期沙眼衣原体感染主要分4个被感染阶段。一是孕早期沙眼衣原体感染。潜在沙眼衣原体感染使子宫内膜产生炎症反应，诱导细胞因子产生，抗沙眼衣原体细胞因子干扰胚胎植入或干扰母体免疫系统，保护胚胎的调节机制引起流产。而中晚孕期沙眼衣原体感染尽管相对较少，但与早产、胎膜早破及低出生体重儿发生存在一定的关系。二是母儿间沙眼衣原体感染。这类感染主要经产道引起新生儿感染。孕妇发生沙眼衣原体感染后，约有50％～60％的新生儿会受到感染，其中25％～50％的新生儿在出生后2周出现沙眼衣原体性结膜炎，10％～20％的新生儿在出生后3～4个月内出现沙眼衣原体性肺炎。三是产褥期沙眼衣原体感染。孕妇患有沙眼衣原体感染时，产褥期沙眼衣原体性子宫内膜炎发生率为28.6％。对于产后子宫内膜炎患者，经一般抗炎无效时，应考虑有沙眼衣原体感染的存在。产褥期泌尿系感染，经常规尿培养阴性者，应检查沙眼衣原体。
