斑痣性错构瘤病是一种遗传性、先天性疾病，所以目前还没有非常好的疗法可以将其彻底治愈。现今的治疗手法多采取对症治疗，即对于该疾病引发的不同症状进行治疗。如神纤维经瘤生长迅速且伴有疼痛，或出现占位症状(如脊柱侧弯、头疼等)时，应尽早施行手术解决;脑脊液循环受阻可手术治疗;面部皮脂腺瘤可行整容术;出现症状性癫痫发作，可以用抗癫痫药物控制发作;病人出现放射性或灼烧样疼痛难以忍受时，治疗上应用治疗神经病理性疼痛的药物减轻疼痛;出现颅内压增高应用脱水剂降颅压。
