疣状角化不良病病因目前尚不明。有人认为本病为单发性Darier病。口腔损害可继发于刺激和外伤，烟草和其他化学性致癌物质与口腔损害的发生可能有关。皮肤损害发生于曝光区，可能与长期紫外线照射有关。亦有人怀疑本病像天疱疮一样，可能存在有引起棘层松解的循环抗体。
