临床上应与其他病因的食管炎、消化性溃疡、各种原因的消化不良、胆道疾病以及食管动力疾病相鉴别。胸痛为主时，应与心源性、非心源性胸痛进行鉴别。吞咽困难者，应与食管癌和食管贲门失迟缓症相鉴别。有吞咽痛、内镜显示有食管炎者，应与感染性食管炎、药物性食管炎等相鉴别。癌和食管贲门失迟缓症相鉴别。有吞咽痛、内镜显示有食管炎者，应与感染性食管炎、药物性食管炎等相鉴别。
