必须和可以采用现代诊断技术查明病因的一些可能复发的慢性脑膜炎相区别。 如单纯疱疹病毒和Epstein-Barr病毒可能在同一患者多次引起由同一病毒所致的脑膜炎;但也有每次复发脑膜炎是由不同病毒所致者。 这些均须采用PCR扩增技术，检测脑脊液病原方能诊断。 又如头皮内的小脓肿可能成为穿透颅骨的病灶，并成为导致复发性细菌性脑膜炎的病因等。
