病毒性脑炎可以进行抗病毒治疗和免疫学治疗，其具体治疗方法如下所述。
1、抗病毒治疗
阿昔洛韦可用于治疗疱疹病毒脑炎，每次10mg/kg，每8小时一次，疗程1周～2周。利巴韦林可用于治疗麻疹病毒脑炎，更昔洛韦对巨细胞病毒脑炎有效。
2、免疫学治疗
激素在病毒性脑炎中的应用一直存在争议，但目前多数学者认为，对重症病毒性脑炎大剂量、短疗程的使用可能有利于炎症和脑水肿的消除，从而降低病死率和神经系统后遗症。激素可选用氢化可的松每次10mg/kg,每日2次～3次；也可选地塞米松每次（0.2～0.5）g/kg，每日2次～3次；或甲泼尼龙每次（1～2）mg/kg,每日2次～3次。对病毒感染后继发脑白质脱髓鞘的患者可给予大剂量激素治疗，开始可选大剂量甲泼尼龙（15～20）mg/kg.d冲击治疗，之后改泼尼松（1.5～2）mg/kg.d口服，2周后逐渐减量停用。也可联合应用大剂量免疫球蛋白400mg/kg.d，连用5天，或1g/kg.d，连用2天。
