但需与流行性感冒、败血症、肺结核、细菌性肺炎、脑炎等病相鉴别，特别是支气管炎型肺疟疾病需与弥漫性肺病鉴别，两者均有咳嗽、气急、听诊有干或湿?音、X线胸片肺纹理增多或小片状阴影，但前者听诊无爆裂音，肺功能限制性通气功能障碍不显著，动脉血氧分压及血氧饱和度较高，血尿素氮值及血乳酸几何平均浓度均较高，血红蛋白低，常有代谢性酸中毒及抗疟治疗后临床症状能缓解等可鉴别。
