肛瘘可以发病于任何年龄阶段，在目前来说，虽说主要是以青壮年最为高发，但其实，小儿，因老年也偶有发病，尤其是3个月左右的婴儿，非常容易出现肛瘘，一定要注意进行预防。下面就肛瘘的病因进行介绍：
1、肠腔中的粪便、肠液和气体继续进入瘘管，刺激管壁，使管壁结缔组织增生变厚，管腔难以闭合;
2、内口的存在，脓肿虽然破溃或已切开引流，但原发感染源如肛窦炎或肛腺感染依然存在，肠腔内容物还可从内口继续进入瘘管;
3、管道多在不同高度穿过肛门括约肌，括约肌收缩阻碍脓液排出，以致引流不畅。
4、肛门部不能静养，脓腔不易粘合，排粪、排尿时，因括约肌收缩或因炎症刺激肛门括约肌，使肛门括约肌经常处于痉挛状态;
5、脓腔引流不畅，或外口缩小，时闭时溃，脓液蓄积腔内，导致脓肿再发并穿破而形成新的支管或瘘道;除此之外，结核克隆重氏病、溃疡性结肠炎等都是形成肛瘘的原因。
肛瘘之所以会反复复发，与治疗不够重视，治疗方式不够规范有一定的联系，但其他方面的病因也是不可忽视的，比如患者应该注意明确自身的患病因素，同时就纠正不良因素，这样的情况下，肛瘘的反复复发几率就大大降低。
