口腔扁平苔藓应与盘状红斑狼疮、白斑，口腔红斑，天疱疮，类天疱疮，苔藓样反应，迷脂症相鉴别：
一、盘状红斑狼疮：多发生于下唇，盘状凹陷，周围有放射状短条纹，病损可超过唇红缘，病理显示血管周围炎症，固有层散在淋巴细胞浸润，面部病损表现为“蝴蝶斑”
二、白斑：白色或白垩色斑块，粗糙稍硬，有时有沟纹或沟裂，病损不发生在单个或少数几个乳头，病理检查对鉴别有重要意义。
三、口腔红斑：红斑间杂，须依靠组织病理检查确诊。
四、天疱疮：口腔黏膜广泛糜烂，尼氏征阳性，病理见上皮内疱，棘层松解，免疫荧光可见网状翠绿色荧光
五、类天疱疮：多发生于牙龈，充血水肿，可见水疱形成。病理见上皮下疱，免疫荧光可见基底膜处带状翠绿色荧光
六、苔藓样反应：患者服用甲基多巴、阿的平、氯喹、氨苯唑、开博通、奎尼丁等药物后，或者使用银汞合金充填物引起，停用可以药物或者去除充填物后病损减轻或消失。
七、迷脂症：皮脂腺异位，多发生于唇颊黏膜，表现为成簇的粟粒大小的淡黄色或黄白色斑疹或丘疹，无自觉症状，一般无需治疗。
