1.子宫内膜异位症 阴道壁子宫内膜异位症病变突出于阴道壁表面，可呈暗红色、糜烂状，也可局部形成结节或息肉样黏膜突起，类似斑点或腺瘤型阴道腺病。但前者常有痛经和性交痛，月经前后病灶可有暗红出血点，镜下见子宫内膜腺体及间质成分。腺腔内常有陈旧性出血。而后者仅有诊断内膜腺体，无内膜间质细胞。
2.中肾管囊肿
(1)阴道中肾管囊肿：可与囊肿型阴道腺病类似，但前者多位于阴道前侧壁，囊肿壁上皮细胞缺乏糖原和黏液，黏液组化染色为阴性。
(2)包涵囊肿：多因分娩、手术或外伤造成阴道壁损伤，在伤口愈合过程中小部分黏膜卷入阴道黏膜下而形成囊肿，多为单个，位于阴道壁下段，与阴道腺病囊肿型类似，但多无症状，病检囊肿内衬复层鳞状上皮，无腺体组织。
3.阴道葡萄状肉瘤 本病也多发生在女婴及幼女，早期表现为阴道分泌物多或阴道出血，但肿瘤多成半透明，形似胚胎状，病理检查肉瘤组织中可找到横纹肌母细胞。
4.阴道透明细胞癌 早期可表现为血性白带、性交出血或阴道不规则出血，病灶局部可形成结节、糜烂、溃疡等，有出血。阴道透明细胞癌可与阴道腺病同时存在，也可有阴道腺病恶变而来。主要依据病理检查明确诊断。
5.阴道鳞癌 患者多为绝经后妇女，阴道病灶呈结节、糜烂、溃疡或息肉样，质硬，触之易出血。经病灶活组织检查可以鉴别。
