肛管癌发展到晚期尚可出现许多侵袭性症状，例如当淋巴结转移并累及闭孔神经时可出现顽固性会阴部疼痛且放射至大腿内侧；肿瘤侵犯括约肌可致大便失禁；侵犯阴道形成肛管-阴道瘘，大便从阴道排出；侵袭前列腺时小便异常或血尿或尿闭；侵袭膀胱时可引起肛管-膀胱瘘；如已发生血道转移，则可出现肝转移、肺转移、胃转移等相应的症状和体征。
