肝内钙化灶的发病原因有: ①肝内胆管结石,是最常见的因素; ②肝内慢性炎症或创伤; ③寄生虫感染; ④肝脏良恶性肿瘤和肝内转移瘤钙化; ⑤先天发育形成,子宫内的胎儿有肝内钙化灶形成,常合并先天畸形,发现率为0.057%。