现认为可能由一种或多种病原微生物或寄生虫引起的慢性小肠感染，与麦胶饮食无明确关系，本病有流行性，季节性，广谱抗生素治疗有效，但粪便，小肠内容物以及肠粘膜中未发现病原菌，营养缺乏，如蛋白质，维生素B族，叶酸等可能与本病发病有关，但不是重要的病因。
小肠粘膜绒毛变形不规则，粗大或变平；呈舌形，脊状或扁平，卷曲状，空肠粘膜活组织检查有腺窝变长，腺窝细胞核肥大，嗜银细胞增多，上皮细胞呈方形或扁平形，杯状细胞减少，上皮细胞酶活力减低，电镜检查见微绒毛不规则，成团分叉多，微粒体和线粒体均有增加，有些病倒同时有浅表性或萎缩性胃炎 。
