(一)发病原因
嗜血流感杆菌为革兰阴性短小杆菌，分为荚膜型和非荚膜型两种。非荚膜型菌株一般不致病荚膜型菌株含荚膜多糖抗原具有型特异性。应用型特异性免疫血清可将荚膜型菌株分为a～f6型以b型致病力最强临床近95%的重症嗜血流感杆菌感染是由b型引起。年龄越小，感染Hib危险性越大，其发病率越高。
细菌感染（40%）：
Hib主要通过空气飞沫或接触分泌物传染，新生儿可通过母亲产道感染。感染多呈散发，常年都有发病，但通常是秋季开始上升，冬季达到高峰由它所致感染中，以呼吸道感染居多。遗传因素可能有较重要的作用。
免疫力低下（35%）：
另外疾病因素如先天性免疫缺陷病、先天性或功能性无脾症、早产、营养不良等均可导致Hib感染的危险性增加。近年来因为大量广谱抗生素的应用白血病或其他恶性淋巴瘤患儿长期应用免疫抑制药，以及气管插管的增多等因素，使Hib感染有增加趋势。
(二)发病机制
最易受侵犯者为婴幼儿，老年人，免疫功能低下者(肿瘤，糖尿病 病人等)，这些人常常发生流感嗜血杆菌性肺炎，败血症 等全身感染。
1.致病机理
流感嗜血杆菌通过其丝状菌毛黏附于口腔及鼻咽部上皮细胞，分泌IgA蛋白酶，防止SIgA对其作用，流感嗜血杆菌产生内毒素的类脂A成分(脂多聚糖LOS)，糖蛋白相关因子或称为低分子葡萄糖肽，可抑制上皮细胞纤毛运动 ， 使流感嗜血杆菌不被排出气道，b型菌株的荚膜多糖有抗吞噬作用，使Hib逃避宿主吞噬细胞的清除作用，再通过丝状菌毛或黏附因子与呼吸道上皮细胞腺结合，流感嗜血杆菌定植后穿入呼吸道上皮细胞屏障，可在局部生长繁殖并向邻近组织扩展，引起呼吸道疾病，也可侵入血流引起败血症，引起全身病变，可通过血行侵入中枢神经系统，引起脑膜炎。
2.免疫反应
荚膜抗原的杀菌抗体，补体，吞噬细胞及中性粒细胞在抗感染免疫中起着重要作用。
(1)抗体：局部SIgA在阻止流感嗜血杆菌黏附于呼吸道黏膜中起重要作用，抗Hib荚膜多糖的杀菌抗体，抗LOS抗体及抗OMP抗体与细菌结合，其Fc段与吞噬细胞结合，对吞噬细胞的吞噬杀菌作用起调理作用，流感嗜血杆菌感染 后诱生的抗荚膜杀菌抗体水平，在<2岁儿童低下，在年长儿则较高，高水平的抗LOS抗体，抗OMP抗体有助于防止Hib疾病复发。
(2)补体：Hib有激活补体经典途径与替代途径的作用，补体通过调理作用促进吞噬细胞的杀菌作用，在感染的早期以替代途径活化为主，在感染的后期则依赖于经典途径的作用，在先天性补体成分缺乏症的小儿，如C2，C3，C4或C3b灭活因子缺乏症的小儿，对流感嗜血杆菌感染的易感性增高。
(3)吞噬细胞：中性粒细胞与单核巨噬细胞共同作用，清除流感嗜血杆菌，在体内主要是由单核-巨噬细胞系统起作用，在脾切除的小儿，对流感嗜血杆菌感染的易感性增高。
