大多数的先天性脊柱侧凸都需要手术治疗。在决定动手术之后，选择何种手术方法也是一件难事，因为每种方法都是有利有弊，如短段植骨融洽，可减少手术对以后的生长影响，但不能控制畸形的发展。而长段融洽，虽然可以更好的制止畸形的恶化，但是一些有生长潜力的椎体受到破坏。
另一方面，由于先天性脊柱侧凸常伴有其它先天性畸形，如先天性心血管疾病、先天性尿道畸形等，这些疾病同样可能危及生命，或者成为手术的障碍，需要提前治疗或同时治疗，这就更加增大了手术的难度。
先天性脊柱侧凸的治疗分为非手术治疗和手术治疗两种方法，具体方法的选择则需要医生在综合考虑患者的年龄，畸形的部位及椎体畸形的类型等因素后做出。
根据年龄决定治疗方法
1、在婴儿刚出生时，对畸形比较轻且进展不明显的患者可以短期观察，也可以用支具或石膏矫正，但用这些方法彻底矫正畸形几乎是不可能的，大多只能起到防止病情进一步恶化，保持现状的作用。
畸形严重的或畸形不断发展的患者则需要接受手术矫正，手术方法最常采用的是原位融洽，也就是将畸形处的脊柱从凸出侧固定起来，从而阻止它向侧边生长，起到矫正畸形的作用。
2、幼儿时期的患者如果畸形轻，进展慢仍然可以用石膏矫正，但对于这一时期的患者更常用的还是手术治疗，包括后方融洽或一期前方矫正，手术时，将畸形处的椎骨固定在一起，同时用哈灵通（Harrington）器械将脊柱拉直。严重的病例则需要将两种手术两期进行。
较大儿童及青少年患者由于畸形常常较为严重，非手术治疗无效，因此需要分两期手术治疗。
根据畸形部位决定手术方法
1、颈椎分节不良伴有颈椎不稳定，以及单侧分节不良且畸形恶化的患者都需要手术融洽治疗，其它颈椎畸形则大多不需要手术治疗；
2、颈部和胸部交界处的的畸形通常采用原位融洽，胸部脊柱的畸形只能选择手术；
3、腰部的畸形通常先进行短段融洽，待生长发育停止后再增加融洽范围；
4、腰部和骶部连接处的畸形比较难于处理，手术也比较复杂，但有一点可以肯定，非手术治疗是无效的。
