病因目前仍然不明，学说甚多，可归纳为两类：
（一）原发性：认为是全身疾病的一种局部表现，可能与缺乏脂类及脂溶性维生素，或与营养障碍，微量元素缺乏或不平衡，遗传因素，胶原性疾病等有关；亦可能与内分泌失调有一定关系，因多发于女青年，并在月经期症状加重，近年来随着免疫学的发展，发现本病患者大多有免疫功能紊乱，故有人认为，本病可能是一种免疫性疾病。
（二）继发性：由局部因素引起，如鼻腔粘膜受到外伤或手术切除过多，或因患特殊传染病如结核，硬结病，麻风 ，梅毒 等所致，慢性肥厚性鼻炎 的晚期，或慢性化脓性鼻窦炎 的长期脓涕刺激，发生纤维结缔组织过度增殖，致使鼻粘膜的血行受阻，营养障碍而致萎缩，鼻中隔极度偏曲，一侧鼻腔宽大，增强的气流的刺激，或因粉尘或有害气体的长期刺激也可致病，曾有人提出本病是由于特殊细菌的感染，如臭鼻杆菌或类白喉 杆菌感染，现认为这些细菌不是真正的病原菌，仅为萎缩性鼻炎的继发感染。
