化脓性颌骨骨髓炎的病程经过，一般可分为急性期和慢性期两个阶段。由发病到死骨开始形成以前可统称为急性期，一般约3～4周。如感染未能在急性期得到彻底控制，则进入慢性期。为了能在急性期控制感染，必须采用足量及有效的抗菌药物治疗。选用药物多用抗金黄色葡萄球菌及混合感染的抗生素，另可根据细菌培养及药敏选择有效抗生素。在感染初期，亦可配合理疗治疗。
当感染进入化脓期，应及早行切开引流。待病情稍为缓解，张口度稍有改善后，应及早拔牙，使脓液从牙槽窝得到引流，防止感染在骨内扩散。
急性化脓性骨髓炎来势急、病情重，可引起血行及颅脑并发症，因此要密切观察病情，早用相应急诊处理。
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