对于任何疾病的治疗，了解病因最为关键，然而像强直性脊柱炎这类疑难杂病，让很多医学研究者犯了愁。强直性脊柱炎有两千多年的历史，然而对于强直性脊柱炎的病因目前还没有一个完全的论述。经过专家对强直性脊柱炎治疗的多年总结，强直性脊柱炎的发病原因主要有以下三个：
一、遗传因素，对于强直性脊柱炎具有遗传性相信大家都有所耳闻。经过对患者的数据调查，强直性脊柱炎患者的亲属发病率比常人高出三十倍左右。研究发现多对孪生兄弟先后出现强直性脊柱炎。强直性脊柱炎患者HLA-B27(人类白细胞抗原B27阳性率高达90%以上，子女HLA-B27阳件占50%，发生强直性脊柱炎的占25%。强直性脊柱炎比类风湿关节炎具有更强的家族遗传倾向。这说明遗传因素对本病起着决定性作用
二、感染因素：感染也是导致强直性脊柱炎的很重要的一个原因。在医学者对强直性脊柱炎的调查研究发现，很多男性强直性脊柱炎患者合并有前列腺炎。另外一些研究发现，本强直性脊柱炎患者中溃疡性结肠炎和局限性肠炎的发病率较一般人高，从而推测致病同素可能是感染。最近有学者研究认为，感染源可能是肠道肺炎克雷白杆菌。他们在实验中发现，不管是强直性脊柱炎患者的大便肺炎克雷白杆菌培养阳性率，还是血清抗肺炎克雷白杆菌抗体水平，都明显高于对照组。对于强直性脊柱炎的感染因素我们不容忽视，预防强直性脊柱炎的同时更应做好防感染工作，由其是肠道感染和慢性泌尿生殖系统感染。
三、其它因素:强直性脊柱炎的其他致病因素还包括病毒感染、外伤感染、甲状腺疾病、肺结核感染、自身免疫缺陷等。但这都缺乏足够的证据，还有待医学者进一步的研究。
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