免疫缺陷者或HIV感染者的生殖器疱疹可适当增加药物的剂量，持续给药直至临床症状缓解。如使用阿昔洛韦治疗后，皮损或症状持续存在，应怀疑HSV对阿昔洛韦耐药。所有耐阿昔洛韦的HSV毒株均对伐昔洛韦耐药，大多数也对泛昔洛韦耐药。可改用膦甲酸钠静脉滴注治疗，剂量为40-60mg/kg，每小时1次，直至临床症状缓解。
妊娠期生殖器疱疹：HSV感染并非终止妊娠的指征，目前主张：
①孕妇初发生殖器疱疹患者可口服阿昔洛韦治疗，有严重并发症而可能危及生命者，应静脉滴注阿昔洛韦治疗。
②对于频繁复发或新近感染的孕妇生殖器疱疹患者，在近足月时，可通过阿昔洛韦治疗以减少活动性损害的出现，从而降低剖宫产率。
③对于既往有复发性生殖器疱疹病史，但近足月时无迹象的孕妇，可不进行阿昔洛韦治疗。
④对于有活动性皮损或有发作前驱症状的孕妇，在无禁忌证的前提下，可于胎膜破裂之前进行剖宫产术，但剖宫产术并不能完全防止新生儿疱疹的发生。
⑤对无活动性皮损的孕妇患者，可从阴道分娩，但分娩后要对其新生儿是否出现发热、昏睡、吃奶时吸吮无力、抽搐或发生皮损进行密切监测，以便及时处理。
新生儿疱疹用阿昔洛韦每日30～60mg/kg，静脉滴注，疗程为10～21天。
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