再生障碍性贫血患者在进行造血干细胞移植前需要先进行配型，配型主要是匹配供者和受着之间人类白细胞抗原(HLA)的相合程度。不完全匹配的供受者之间的移植可能导致移植排斥反应和移植物抗宿主病。
在具体HLA配型过程中，只有两个个体的HLA配型完全相同才能进行造血干细胞移植，否则可能会发生两种情况，一是患者体内的免疫细胞把植入的供体细胞当作异物或入侵者进行攻击，称为移植排斥反应，其结果是移植失败，造血干细胞不能在患者体内植活。另一种可能是供体的造血细胞在患者体内植活，产生大量的免疫活性细胞，这些细胞反客为主把患者的组织和细胞当作异物和入侵者进行攻击，最容易受攻击的组织和器官是皮肤、肝脏和肠道，发生皮疹、黄疸、转氨酶升高和腹泻不止甚至血便，称为移植物抗宿主病，严重者可致命。
在具体HLA配型过程中，主要进行HLA-A、HLA-B和HLA-C三对位点的配型，由于HLA-A、HLA-B的多样性最明显，一般对供者先做这两个分型，待检索供、受者HLA-A、HLA-B相配后，再对供者作HLA-C分型检测，如果供、受者的HLA完全相配，同时供者健康检查合格，就可以着手准备移植手术。
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