多囊卵巢综合症和甲状腺功能异常都是腺体分泌的激素异常而出现的功能紊乱，表现出相似的表现，但二者其实是不同的。
多囊卵巢综合症多数学者认为是下丘脑-垂体-卵巢轴的调节功能紊乱，垂体分泌的FSH减少，LH增多，阻碍卵泡发育和排卵，卵泡停留在小卵泡阶段，无优势卵泡发育，故无卵泡成熟与排卵，出现卵巢功能减退和高雄激素血症。主要表现为：月经失调，不孕，多毛，肥胖，黑棘皮症，双侧卵巢增大。
甲状腺功能异常可引起雌激素代谢障碍、FSH及LH分泌异常，常表现为明显的卵巢功能不全而很少妊娠。目前，多认为甲状腺素有刺激卵泡成熟的作用，可间接影响肾上腺和性腺。因此，甲状腺功能异常常常导致月经异常、闭经、排卵障碍和不孕不育。主要表现为：
1、甲状腺功能亢进症，简称甲亢。病人学期T3、T4、性激素结合球蛋白（SHBG）增高，雄激素代谢清除率降低，使血浆睾酮升高致男性化和月经失调，一般是经量变少，严重者闭经。
2、甲状腺功能减退症，简称甲减。T3、T4减少，促甲状腺素和粗甲状腺素释放激素水平升高，出现月经过多和无排卵。严重者子宫内膜萎缩直至闭经。
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