卵巢两性母细胞瘤的治疗根据患者年龄、生育状况的不同，可以分别采用患侧附件切除、患侧附件及子宫切除、双侧附件及子宫切除等不同的手术方式。
目前，卵巢两性母细胞瘤被视为良性肿瘤，因为肿瘤在形态学上呈良性表现，尚无临床复发及转移的报道。当肿瘤成分中有大量颗粒细胞瘤成分时(无论为幼年型或成人型)，因颗粒细胞瘤属低度恶性肿瘤，有早期(幼年型)或晚期(成人型)复发的可能，对这组病人要长期严密随诊，并争取用血浆肿瘤标记inhibin、MIC2等监测。由于目前病例少，缺乏长期随诊的报告，对于肿瘤的预后还需今后深入观察研究，才能有确切的定论。
