全身治疗：及早应用足量抗生素或其他抗菌药物控制感染，务求彻底治愈。一般可用青霉素类、头孢类等药物。如早期治疗及时得当，可防止鼓膜穿孔。规模穿孔后取脓液作细菌培养及药敏试验。参照其结果改用敏感的抗生素。抗生素需使用10天左右，注意休息，疏通大便。全身症状重者给以补液等支持疗法。小儿鼓膜较厚，不易穿孔，为避免感染蔓延至颅内必要时可考虑鼓膜切开术，通畅引流缩短病程，防止并发症。若出现乳突气房融溃积脓时，应及时行乳突切开术。
急性化脓性中耳炎病程超过6~8周，病变侵及中耳粘膜、骨膜或深达骨质造成不可逆损伤称为慢性化脓性中耳炎。儿童期慢性化脓性中耳炎往往需要待患儿咽鼓管功能改善后手术治疗 。
