婴儿痉挛症的主要并发症为出现智力发育障碍、体格生长迟缓、痉挛性瘫痪、四肢瘫、小头畸形等，婴儿痉挛症初发时60％～70％的患儿智力低下，满2岁时可增加到85％～90％。无论病前有无智力落后，一旦痉挛发生，相继出现智力发育障碍。95％的病例有精神运动发育落后。
